A molécula: estrutura e química
A timosina alfa-1 é um peptídeo pequeno, ácido e N-acetilado que não assume uma forma preferida em água pura e adota…
Vinte e oito resíduos ácidos com uma tampa acetil
A timosina alfa-1 é um peptídeo pequeno, ácido e N-acetilado que não assume uma forma preferida em água pura e adota estruturas parcialmente helicoidais em uma mistura de água e trifluoroetanol. Nenhum receptor específico é conhecido para ela, e por isso sua química recebe tanta atenção.
Esta unidade percorre a estrutura: a sequência de 28 resíduos, a cobertura acetila, o caráter ácido, a hélice dependente do solvente e por que ser um fragmento da protimosina alfa molda como a molécula é entendida e fabricada.
Termos-chave
Lendo a sequência de 28 resíduos
A timosina alfa-1 é uma cadeia de 28 aminoácidos, incomumente rica nos resíduos ácidos aspartato e glutamato. A extremidade da frente é coberta por um grupo acetila e a extremidade de trás é um ácido livre. Em vez de listar todos os 28, ajuda ver os resíduos de referência que definem seu comportamento.
A conclusão é composicional. Uma cadeia tão ácida e tão curta se dissolve em água, até cerca de 2 mg/mL para a base livre, e o dicroísmo circular mostra que ali ela não assume nenhuma conformação preferida (nenhuma forma dobrada estável). O estudo de RMN de 2011 de fato observou flexibilidade entre suas duas regiões estáveis em trifluoroetanol a 40%; que essa flexibilidade permita a um único peptídeo pequeno interagir com vários parceiros diferentes é uma proposta, não um resultado medido.
AvançadoA sequência completa, para referência
A sequência de 28 resíduos (de N a C) é Ac-Ser-Asp-Ala-Ala-Val-Asp-Thr-Ser-Ser-Glu-Ile-Thr-Thr-Lys-Asp-Leu-Lys-Glu-Lys-Lys-Glu-Val-Val-Glu-Glu-Ala-Glu-Asn. Conte os aspartatos e glutamatos e o caráter ácido fica evidente. O peso molecular de 3.108 daltons é o número do fabricante, e um estudo de espectrometria de massas de 2013 com Tα1 recombinante e acetilada mediu a mesma massa.