La molécula: estructura y química
La timosina alfa-1 es un péptido pequeño, ácido y N-acetilado que no adopta una forma preferida en agua pura y toma…
Veintiocho residuos ácidos con un remate acetilo
La timosina alfa-1 es un péptido pequeño, ácido y N-acetilado que no adopta una forma preferida en agua pura y toma estructuras parcialmente helicoidales en una mezcla de agua y trifluoroetanol. No se conoce un receptor específico para ella, y por eso su química recibe tanta atención.
Esta unidad recorre la estructura: la secuencia de 28 residuos, el casquete acetilo, el carácter ácido, la hélice dependiente del solvente y por qué ser un fragmento de la protimosina alfa condiciona cómo se entiende y se fabrica la molécula.
Términos clave
Leyendo la secuencia de 28 residuos
La timosina alfa-1 es una cadena de 28 aminoácidos, inusualmente rica en los residuos ácidos aspartato y glutamato. El extremo delantero está tapado con un grupo acetilo y el extremo trasero es un ácido libre. En lugar de enumerar los 28, ayuda ver los residuos de referencia que definen su comportamiento.
La conclusión es de composición. Una cadena tan ácida y tan corta se disuelve en agua, hasta unos 2 mg/mL para la base libre, y el dicroísmo circular muestra que en ella no adopta ninguna conformación preferida (ninguna forma plegada estable). El estudio de RMN de 2011 sí observó flexibilidad entre sus dos regiones estables en trifluoroetanol al 40%; que esa flexibilidad permita a un único péptido pequeño interactuar con varios compañeros distintos es una propuesta, no un resultado medido.
AvanzadoLa secuencia completa, como referencia
La secuencia de 28 residuos (de N a C) es Ac-Ser-Asp-Ala-Ala-Val-Asp-Thr-Ser-Ser-Glu-Ile-Thr-Thr-Lys-Asp-Leu-Lys-Glu-Lys-Lys-Glu-Val-Val-Glu-Glu-Ala-Glu-Asn. Cuenta los aspartatos y glutamatos y el carácter ácido resulta evidente. El peso molecular de 3108 daltons es la cifra del fabricante, y un estudio de espectrometría de masas de 2013 sobre Tα1 recombinante y acetilada midió la misma masa.